，以及河东、河内、河南的三河骑兵，同时招募精壮之士共计四万多人。二人各率一部，共同镇压颍川黄巾军。
朱儁先与黄巾军波才部作战，失败。皇甫嵩只得退守长社，波才率军围城。当时城中兵少，众寡悬殊，军中震恐。皇甫嵩安慰部下说道：“用兵有奇变，而不在兵数量多少。现在贼人依草结营，容易因风起火。如果乘黑夜放火焚烧，他们一定惊恐散乱，我出兵攻击，四面合围，田单守即墨用火牛攻燕而获胜的功劳就可以实现。”
一切正如皇甫嵩所料，当晚大风骤起。皇甫嵩命令将士扎好火把登上城墙，先派精锐潜出围外，纵火大呼，然后城上点燃火把，与之呼应。皇甫嵩借此声势，鸣鼓冲出。那黄巾军本是各地流民变民集结而成，缺乏战斗经验，见到此情景难免惊慌散乱，被迫后撤。这时骑都尉曹操也奉命率军赶来，于是皇甫嵩联手曹操、朱儁合兵一处，乘胜追击。黄巾军顽强抵抗，数万人惨遭屠戮。而后皇甫嵩又和朱儁一起乘胜镇压汝南、陈国地区的黄巾军，并追击波才、进攻彭脱，连连取胜，平定了三郡之地。
八月，皇甫嵩在苍亭击败黄巾卜已部，擒获卜已，屠杀七千多人。这时，张角占据广宗，控制河北腹地，卢植为宦官所诬，被召回，于是朝廷下诏命皇甫嵩率兵进击。在这紧要关头，张角病死，其弟张梁继而守卫广宗。皇甫嵩攻城，因张梁军精锐未能得逞，便闭营休士，以观其变。等到张梁被迷惑，放松了警惕时，皇甫嵩立即乘夜调兵，鸡鸣时分冲入其阵，黄巾军仓促应战，张梁战死，阵亡三万多人，投河而死的有五万多人。皇甫嵩焚烧黄巾辎重车三万多辆，将张角“剖棺戳尸，传首京师”。
十一月，皇甫嵩与巨鹿太守郭典攻克下曲阳，杀死张角弟弟张宝，俘杀十余万人。皇甫嵩将十万人的尸骨筑成了“京观”。朝廷任皇甫嵩为左车骑将军，领冀州牧，并晋封他为槐里侯，食槐里、美阳两县的租
税，食邑共八千户。
平定黄巾主力之后，皇甫嵩奏请免除冀州一年田租，用来赡养饥民，先帝听从了他的建议。冀州百姓作歌谣称赞皇甫嵩道：“天下大乱兮市为墟，母不保子兮妻失夫，赖得皇甫兮复安居。”
皇甫嵩以雷霆血腥之威镇压黄巾叛军，威震天下，但当时朝政日下，海内空虚。汉阳人阎忠劝他把握机会，率领大军不要班师回朝，而是直接南下割据一方，与朝廷划江而治，从此设立百官文武，在南方临朝称制。皇甫嵩断然拒绝了他，领兵回了洛阳。皇甫嵩知道自己功高震主，于是回到洛阳后即刻交付了兵权，在洛阳城中闭门谢客，从此深居简出，世人因此对他的评价又上层楼，称其为当世军神。但又因讨伐黄巾之乱时杀孽太重，不少人也称皇甫将军为杀神。
就是这样一个传说中级别的人物，现在就如此平静地出现在我们两人身前。我感受到即使是吕布也有着不寒而栗的敬意，这皇甫嵩看起来和卢植卢博士差不多年纪，样貌也不甚容伟，可是他毕竟手上沾染过几十万人的鲜血，他现在身边所带领的两百骑兵想来也是一路跟随他东征西讨，马踏数万鲜活生命而过来的身经百战的骁骑。我和吕布此刻身边只有十名西凉骑兵，在这夜色中和皇甫嵩在洛阳城北的石桥上狭路相逢，不知道接下来该何去何从。
吕布沉默半天，和皇甫嵩两人不发一言地对视着。我们身后跟着的西凉骑兵各个无所畏惧，显然对身前杀气腾腾的皇甫骑兵不放在心上，颇有一种死生随缘的从容感。这时皇甫嵩提马向前走了两步，对吕布率先开口道：“回去吧，这里不让过。”皇甫嵩的声音不大，却极有威严，他身边的副将见状也跟上来重复了一遍道：“听见了没有，皇甫将军说了，叫你们回去！”
关于洛阳城中这些风云人物的传说基本上都是吕布讲于我知的，所以他肯定比我更清楚眼前皇甫嵩的实力究竟如何。皇甫嵩如此客气地劝退我们已经是非常给面子的了，毕竟我和吕布一无名气二无军功，面对一个名扬海内的大人物，能如此礼遇我们已经是非常不容易了。
吕布想了想，翻身下得马来，跪拜在地上对皇甫嵩说道：“今朝廷微弱，幼主被挟，但凡汉室子民都应当尽心尽力迎回皇上，确保陛下安全无虞。河东郡的白波谷十万大军会同南匈奴一万精锐骑兵已经在奔赴洛阳的途中，大将军
生前所召四方之兵现在也已屯驻在洛阳八方角落，眼下城里城外危机重重，又怎能眼睁睁看着皇帝被走投无路的十常侍裹挟着远遁别处呢？还请皇甫将军网开一面，放小人过去，追迎皇帝陛下回宫主持洛阳大局。不然洛阳一乱，各地诸侯拥兵自立，天下将再无安定之日。”
吕布说得每一句都诚心诚意，皇甫嵩面无表情地看着吕布，直到他说完后才叹了口气，反问吕布道：“在你眼中看来天下尽是奸佞之臣，可是你又如何保证你主袁绍是什么忠正贤能了？”
皇甫嵩说着，眼睛又瞟到吕布身后的十骑西凉骑兵身上，不悦之意浮于脸上，似乎认为袁绍已经和董卓达成协议，待追回皇帝后要共同瓜分这洛阳城内的权势荣华。
吕布看出皇甫嵩的猜忌之心，于是坦诚布公道：“实不相瞒，我本是并州刺史部的刺