负责指挥舰队。
至于何云魁的参谋长，主要的任务是制定作战、训练计划，协助司令进行训练指挥。
紧接着，何云魁便着手对天津水师进行了整编。在来的路上，李峰早就和何云魁进行了交代，何云魁也是经历过好几次部队的整编了，经验比较丰富。
那些水师的老兵们，全部被打散分配到新军的官兵之中，一同进行训练，每天都是同吃同住，进行为期一个月的磨合。
在成立大会上，召集所有的军官士兵们开会，要大家相互学习，相互帮助，相互进步。新军的士兵要向那些老水师的军人学习海上驾驶和作战的本领；老水师的军人也要向新军的士兵们学习，学习他们严格执行条令，纪律严明，服从命令的精神。同时李峰要求所有的各级军官要一身作则，尽快将两支队伍融合成一个整体。
大会之后，这里就交给何云魁了。
何云魁制定的训练计划，是每天上午进行队列训练，下午进行军事训练，晚上进行文化和海事学习。原先海师的所有军官们，也都被打散分到士兵中，和所有人一起训练。用李峰的话说，今后的若是还想担任军官，那么一切都看这段时间的表现而定。
原先水师的官兵们，在训练的第一天，就有些吃不消了，他们没有想到这帮新军们的训练居然这么严格。尤其是那个队列，站的时候，一动不能动，走的时候，要完全步伐一致。
不过，即使如此，那些水师的官兵们却是没有提出来要后退的。因为他们听说了，这皇家海军的待遇可是相当高。普通的水兵，光是饷银一个月就能达到三两银子，出海的时候，还会另有补助。若是当上了军官，那银子就更多了，而且听说这新军中，是从来都不克扣饷银的。这不，他们刚开始改编，这个月的银子就发了下来，沉甸甸的，足足的三两银子，这可是这些穷的只能靠打渔度日的士卒们从来都没有遇到过的事情。
在过了半个多月之后，这些原先的水师官兵们终于是脱胎换骨了。除了肤色比新军的官兵要黑一些之外，在队伍中，也能够做到整齐划一了。
而且，现在军营中，随着新军的进驻，面貌得到了极大的改观。所有的杂草垃圾都被铲除了；所有的营房都被士兵们收拾利索，粉刷一新；所有的道路水渠都被休整的笔直；所有的营房中，物品都摆放的整整齐齐。虽然条件暂时还不好，但是已经焕发了新生。这些水师的官兵们，可是见识了这个何参谋长的厉害，整天戴着一个白色的手套，在营院里转圈，走到哪儿摸到哪儿。若是摸到什么门框、桌子上有灰，绝对会将那头儿训个狗血喷头。
十天后，新军的士兵们，每天都用半天的时间到水师的各类船上实习，出海适应性训练。
整合二十多天之后，终于，李峰宣布了任命。
李秉如担任副司令，兼任旗舰天津舰的舰长；何云魁担任参谋长，原十三山堡出来的武备学院队长徐勤担任沈阳舰的舰长；原海师的船长、佐领王谦担任辽阳舰舰长；原海师福船的船长吴大奎担任锦州舰舰长。
这四艘舰船，就是新式蒸汽战船的名字。
李峰对皇家海军的士兵们是这样讲道为何会用这些城市来命名的：“不论我们身处万里海疆之外，大家都要谨记，我们保卫的是大明。在大明，有我们的家乡，有我们的父老乡亲！”其他的福船和海沧船、苍山船，也都指定了舰长和船长。李峰用人的原则是，让老水师的人和新军的军官形成搭配。若是舰长是新军来的，那么副舰长一定是水师的人，舰长是水师的，那么副舰长一定就是新军的人。这样做的目的，是要尽快地进行融合，以老带新。因为随后会有更多的战舰列装，到那个时候，有船没人可不行。十一月初五，李峰便带着所有的水手，前往船厂接收战船。
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